ჩინეთიდან და გერმანიის მკვლევარებმა პირველად მთლიანად გაშიფრეს კარტოფილის გენომი, იუწყება TASS. ეს მათ დაეხმარა მცენარის ევოლუციური ისტორიის აღმოჩენაში და დნმ-ის ძირითადი სექციების იდენტიფიცირებაში, რომლებიც დაკავშირებულია ზრდასთან და დაავადების წინააღმდეგობასთან. ამის შესახებ ინფორმაციას გერმანიის მცენარეთა მოშენების ინსტიტუტის (IPZ) პრესსამსახური ავრცელებს.
„კარტოფილის გენომის გააზრება საშუალებას მოგვცემს წამოვიწყოთ მაღალეფექტური მეცხოველეობის პროგრამები, რომლებიც შექმნიან ახალ ჯიშებს, რომლებიც მაღალმოსავლიანი და მდგრადია გლობალური დათბობის მიმართ, რაც კრიტიკული იქნება მომდევნო ათწლეულებში“, - თქვა IPZ-ის პროფესორმა კორბინიან შნებერგერმა.
კარტოფილის კულტივაციას აფერხებს მრავალი სოკოვანი და ბაქტერიული დაავადება, ასევე სხვადასხვა მავნებელი, როგორიცაა კოლორადოს ხოჭო და ნემატოდები. მეცნიერები და სელექციონერები მათთან ბრძოლას ჩვეულებრივი და გენმოდიფიცირებული კარტოფილის ახალი ჯიშების შექმნით ცდილობენ.
პროფესორმა შნებერგერმა და მისმა კოლეგებმა მიიღეს ამ პრობლემის პოტენციური გადაწყვეტა ფართომასშტაბიანი პროექტის ფარგლებში, რომელიც მიზნად ისახავს კარტოფილის გენომის სრულად გაშიფვრას. წარსულში მეცნიერები უკვე ცდილობდნენ ამ ინფორმაციის მოპოვებას, მაგრამ ამას ხელს უშლიდა კარტოფილის გენომის უკიდურესად რთული სტრუქტურა - ის შედგება ქრომოსომების ოთხი იდენტური ნაკრებისგან, რომლებიც შეიცავს დიდი რაოდენობით გამეორებას.
დნმ-ის თანმიმდევრობის ახალი ტექნოლოგიები და გენეტიკური ინფორმაციის ანალიზის ალგორითმები დაეხმარა გერმანელ და ჩინელ გენეტიკოსებს ამ პრობლემის გადაჭრაში Otava ჯიშისთვის. გენომის გასაშიფრად მეცნიერებმა შეაგროვეს დიდი რაოდენობით მტვრის მარცვალი, რომელთა გენეტიკური მასალა შეიცავს ქრომოსომის მხოლოდ ორ და არა ოთხ ასლს.
ამ მიდგომამ საგრძნობლად გაამარტივა ამოცანა, მაგრამ ამავე დროს მოითხოვდა დნმ-ის ფრაგმენტების ძალიან დიდი რაოდენობის გაშიფვრას და მათ შემდგომ კომბინაციას კომპიუტერული ალგორითმების გამოყენებით. საბოლოოდ, მეცნიერებმა მიიღეს კარტოფილის სრული გენომის ვირტუალური ასლი, რომელიც შედგება დაახლოებით 3,1 მილიარდი გენეტიკური „ასო“-ნუკლეოტიდისგან და შეიცავს 38 ათასზე მეტ გენს.
მათი სტრუქტურის შემდგომმა ანალიზმა გამოავლინა კარტოფილის რთული ევოლუციური ისტორია. მეცნიერებმა აღმოაჩინეს, რომ ამ კულტურამ შედარებით ცოტა ხნის წინ განიცადა გენომის გაორმაგება შეჯვარების შედეგად. გარდა ამისა, მეცნიერებმა აღმოაჩინეს უჩვეულო განსხვავებები სხვადასხვა ქრომოსომაზე მდებარე ერთი და იგივე გენების ასლების აქტივობის დონეზე, რაც პოტენციურად იმოქმედებს სხვადასხვა ჯიშის კარტოფილის გადაკვეთის ეფექტურობაზე.
მეცნიერები იმედოვნებენ, რომ ეს ინფორმაცია ხელს შეუწყობს ახალი ჯიშების განვითარებას ან გენომის მოდიფიკაციას, რათა კარტოფილი უფრო სწრაფად გაიზარდოს, უკეთ გაუძლოს გვიან დაავადებებს და სხვა დაავადებებს და ასევე ნაკლებად მგრძნობიარე იყოს სხვადასხვა სტრესული ფაქტორების მიმართ.